Der Anime Marathon nimmt für sich in Anspruch, noch vor der AnimagiC als Convention ins Leben gerufen worden zu sein und damit eine lange Tradition zu haben. Der Name dürfte sich davon ableiten, dass quasi wie beim Marathon endlos - insbesondere die Nächte durch - Animes geguckt wurden. Auch heute ist dieser Programmpunkt mit den nächtlichen Animes fest verankert.

Der Anime Marathon findet momentan fest in Königslutter statt, während er in früheren Jahren immer an anderen Standorten stattfand.